Aqui você pode ajustar as configurações de serviço - quais serviços devem ser executados por padrão, etc. Como exemplo, se você não quiser/precisar acessar o sistema via SSH, deve desativar e parar o SSH e o Denyhosts.
Nautilus abre uma janela para cada pasta por padrão - para mudar isso, abra qualquer pasta e edite as configurações. Também é uma boa ideia habilitar o comando de exclusão que ignora a lixeira - porque se você excluir algo de dispositivos externos com o comando de exclusão padrão, as coisas não serão realmente excluídas, mas movidas para uma lixeira no dispositivo (.trash). Essa lixeira não será afetada quando você excluir a lixeira na sua área de trabalho.